Satu bahagian yang bertanggungjawab di atas pentadbiran Jabatan Hal Ehwal Islam Negeri Sabah. Bahagian ini terdiri daripada enam (6) unit.

Ketua Penolong Pengarah Bahagian Khidmat Pengurusan & Kewangan ialah Puan Anita Binti Mohd Taib.

Unit Pentadbiran Am

Fungsi unit

1. Pengurusan Rekod & Fail
2. Pengurusan Kenderaan
3. Pengurusan Stor
4. Pentadbiran Pejabat
5. Pengurusan Utiliti    

Unit Latihan & ICT

Fungsi unit

1. Pengurusan ICT
2. Latihan
3. Pengurusan PTM & PROSPEK

Unit Prestasi & Latihan Industri

Fungsi unit

1. Menyelaras dan Memantau Pelaksanaan Pengisian SKT
2. Memberi Panduan dan Latihan Pelaksanaan SKT
3. Menyelaras Penempatan Pelajar Latihan Industri
4. Menyediakan taklimat, garis panduan Pelajar Latihan Industri
5. Memantau dan Menilai Prestasi Pelajar Latihan Industri
6. Menguruskan proses pemilihan dan penganugerahan Anugerah Perkhidmatan Cemerlang

Unit Perolehan

Fungsi unit

1. Pengurusan Inventori    
2. Pengurusan Perolehan
3. Pengurusan Sebut harga & Tender.

Unit Pejawatan & Perkhidmatan

Fungsi unit

1. Perancangan Keperluan & Penggunaan Tenaga Manusia   
2.  Tatatertib
3. Pengambilan / Pelantikan   
4.  Elaun-elaun
5. Rekod Perkhidmatan    
6. Penguatkuasaan Skim Perkhidmatan
7. Jadual Gaji Khas untuk Penyandang    
8. Pemangkuan / Tanggungan Kerja
9. Pengurusan Perjawatan    
10. Penetapan Gaji
11. Pertukaran Pelantikan    
12. Persaraan
13. Kemudahan Cuti    
14. Perancangan Sumber Manusia
15. Pengisytiharan Harta    
16. Kenaikan Pangkat
17. Struktur Organisasi    
18. Hadiah Pergerakan Gaji
19. Percubaan    Pergerakan Gaji
20. Pengesahan Jawatan / Pemberian Taraf Berpencen / Pelanjutan Tempoh 

Unit Kewangan

Fungsi Unit

1. Penyediaan penyata gaji
2. Penyediaan input gaji
3. Pengurusan pembayaran gaji vot peruntukan jabatan & vot terbuka
4. Membuat penyesuaian semua peruntukan bayaran am jabatan
5. Pengurusan pembayaran bil-bil atau invois daripada syarikat-syarikat & pembekal
6. Membuat penyesuaian vot peruntukan gaji jabatan & vot terbuka
7. Pengurusan tuntutan pembayaran seperti tuntutan perjalanan & sara hidup daripada kakitangan
8. Menyemak baucar-baucar tuntutan bayaran am & dokumen-dokumen sokongan